Το τμήμα χάντμπολ της ΑΕΚ δημιουργήθηκε το 2005.

Στην ιστορία της,η ομάδα έχει κατακτήσει 5 πρωταθλήματα και 4 κύπελλα ενώ από το 2007 αγωνίζεται συνεχώς στα Ευρωπαϊκά κύπελλα.

Αναλυτικά:
Έτος ίδρυσης: 2005
Νταμπλ: 2013-2021

Treble:2021
Πρωταθλήματα: 2011-2013-2020-2021-2023
Κύπελλα: 2009-2013-2014-2021

EHF European Cup:2021

​​​